| CPU和GPU协同并行加速多生物序列比对 |
| 杨春燕;钟诚; |
| 关键词：多生物序列;并行比对;计算窗口;CPU和GPU协同计算;主库约减 |
| 主要内容：将主库构建阶段的输入序列分成多个分主库、将主库扩展阶段的主库元素划分成多个计算窗口,使之符合GPU并行计算的线程结构特性,GPU以计算窗口为单位并行计算比对矩阵、并行约减主库及并行扩展比对矩阵,结合库优化思想优化主库构建过程,利用阈值cut |
| 《小型微型计算机系统》 2016(12).2780-2784 |
| 全文下载请进入http://hightech.stlib.cn/tpi_1/sysasp/include/index.asp |
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