计算DNA序列模式特征的匹配算法
 
戴胜冬;杨昆;

关键词:算法;生物信息学;DNA序列;模式匹配
 
主要内容:分析了DNA序列特征计算过程中的特殊性,提出了一种基于"空间换时间"的模式匹配算法,设计了以map数据结构来存储中间结果的方案,使得扫描DNA序列一次即可同时计算所有元组模式在该序列中出现的次数。实验结果及分析表明,算法提升了DNA序列模式
 
《杭州电子科技大学学报(自然科学版)》  2015(1).88-92
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