蛋白质结构型的定义和识别
 
李晓琴 罗辽复

关键词:蛋白质结构型 二级结构序列 紧结构域 序列冗余 预测 识别
 
主要内容:提出紧结构域的概念,由二级结构序列中一段或几段连续的α螺旋和β折叠构成的空间紧密堆集的最大折叠体称为紧结构域,利用3种紧结构域(α域,β域和α/β域)定义球蛋白的5种结构型:α型蛋白,β型蛋白,α/β型蛋白,多域蛋白和ξ型蛋白,将1261个代表性的蛋白质(1022家族)进行分类,并和SCOP库的分类做了比较,进行了删去序列冗余的分析,在此基础上提出结构型的预测方案,成功率在82%-85%。
 
《生物化学与生物物理进展》  2002,29(1).-124-127
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