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| 一种提高固定pH梯度(IPG)凝胶双向电泳的重复性、分辨率和通量的方法 |
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| 袁泉 安杰 刘定干 赵辅昆 |
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| 关键词:双向电泳图谱 固定 人肝癌细胞 SDS 蛋白质组学 聚丙烯酰胺凝胶电泳 3T3细胞 细胞器 匹配率 通量 |
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| 主要内容:在蛋白质组学研究中,双向聚丙烯酰胺凝胶电泳是现行蛋白质分离的最重要的方法之一。实验发展了一种提高固定pH梯度(IPG)凝胶双向电泳的重复性、分辨率和通量的方法:住一块SDS-聚丙烯酰胺凝胶上同时进行多块固定pH梯度(IPG)凝胶(Multi-strips on one SDS gel,MSOG)电泳。用此方法比较了人肝癌细胞、不同生长状态的人肝癌细胞、3T3细胞的蛋白质以及同一个样品在不同大小的第二向凝胶系统(大型和中型凝胶)的双向电泳图谱。结果表明,同一样品在13cm IPG Strip双向电泳可分离2000以上蛋白质点且图谱蛋白质点的匹配率可超过95%以上。同时又可以最大程度地降低凝胶背景对蛋白质点比较分析的干扰,从而提高了双向电泳分离蛋白质的分辨率和通量。这些优点都有助于差异蛋白质组学特别是细胞器差异蛋白质组学研究的自动化。 |
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| 《生物化学与生物物理学报:英文版》 2003,35(7).-611-618 |
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