基于支持向量机的蛋白质同源寡聚体分类研究
 
张绍武[1] 潘泉[1] 陈润生[2] 张洪才[1]

关键词:支持向量机 蛋白质 同源寡聚体 分类 贝叶斯协方差判别法
 
主要内容:基于支持向量机和贝叶斯方法,从蛋白质一级序列出发对蛋白质同源二聚体、同源三聚体、同源四聚体、同源六聚体进行分类研究,结果表明:基于支持向量机,采用“一对多”和“一对一”策略,其分类总精度分别为77.36%和93.43%,分别比基于贝叶斯协方差判别法的分类总精度50.64%提高26.72和42.79个百分点。从而说明支持向量机可用于蛋白质同源寡聚体分类,且是一种非常有效的方法.对于多类蛋白质同源寡聚体分类,基于相同的机器学习方法(如支持向量机),采用“一对一”策略比“一对多”效果好,同时亦表明蛋白质同源寡聚体一级序列包含四级结构信息。
 
《生物化学与生物物理进展》  2003,30(6).-879-883
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