| 利用生物信息学手段获得两个对硫磷水解酶 |
| 林毅[1] 洪雪梅[2] 关雄[3] |
| 关键词：生物信息学 对硫磷水解酶 农药降解 枯草杆菌 基因组 黄杆菌 芽孢杆菌 |
| 主要内容：以黄杆菌(Flavobacterium)对硫磷水解酶(parathion hydrolase)的序列(AAA24930．1)对芽孢杆菌的基因组进行BLASTP，从Bacillus halodurans中发现两个对硫磷水解酶类似蛋白PTEa和PTEb，长度分别为679和331个氨基酸。利用conserved domain search和motif scan软件分析的结果证实它们具有对硫磷水解酶的结构特征。PTEa和PTEb的对硫磷水解酶上游标志区分别是“GVCACHEHL”和“GFTYSHEHI”，与标准的“G—x—T—L—x—H—E—H-【LIV]”大致吻合。PTEb的对硫磷水解酶下游标志区“AVARAHHETKAPIHSH”也与典型的“A—x—A—x—A—x(4)-G—x—P-[LIVM]-x(2)-H”基本一致，而PTEa中缺乏明显的下游标志区。PTEb序列对枯草杆菌基因组TBLASTN的结果表明枯草杆菌也可能存在对硫磷水解酶类似蛋白。 |
| 《江西农业大学学报.2004,26(1).-6-9》 |
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