| 采用伪氨基酸组成预测水解酶亚家族 |
| 李红春 张光亚 方柏山 华侨大学学报：自然科学版 2010,31(3).-317-321 |
| 水解酶亚家族 特征值 伪氨基酸 k-近邻 |
| 利用伪氨基酸组成提取蛋白序列特征值,考察参数λ和w对识别效果的影响,以k-近邻作为基础分类器,用于预测水解酶的亚家族类型.结果表明,伪氨基酸组成特征提取法与单纯的20个氨基酸组成特征方法相比,其识别精度有较大程度提高.20AA组成的平均预测精度为72.3%,而伪氨基酸组成特征提取的识别效果可达82.7%.在参数影响考察方面,自相关性函数个数的选取对识别效果影响较大,而权重因子w对识别效果影响则很小. |
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