| 利用序列比较寻找胰岛素基因表达启动区与DNA结合蛋白的结合位点 |
| 谢建明 董献军 徐伟 王崎 周士新 孙啸 陆祖宏 |
| 关键词：序列 胰岛素基因 表达启动区 DNA结合蛋白 结合位点 |
| 主要内容：NDFl、IPFl和HNF4是与胰岛素基因表达有关的DNA结合蛋白，通过比较SWISSPROT蛋白质数据库中人类、小鼠、大鼠这三种核蛋白氨基酸一级序列、模体和结构域，发现其结构十分相似，根据蛋白质结构和功能的关系，推测这些DNA结合蛋白与胰岛素基因结合的核苷酸序列相似；从GenBanl(核酸数据库中获得人类、小鼠、大鼠胰岛素DNA序列，用ClustalW比较三者Promoter区的核苷酸序列，显示有一段核苷酸序列较为相似，同时搜索TRANSFAC基因转录数据库中NDFl、IPFl和NHF4蛋白核苷酸结合位点，发现核酸比对保守的部分序列与TRANSFAC数据库中这三个转录因子的DNA结合位点一致，另外一些核酸保守序列可能为其他未知DNA结合蛋白的结合位点。这种核酸序列比对设计为分子生物学实验寻找和验证胰岛素DNA结合蛋白与核苷酸的结合位点提供了简单而实用的方法。 |
| 《生物物理学报》 2003,19(2).-161-166 |
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