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| 笛鲷属(Lutjanus)鱼类线粒体16S rRNA基因序列比较及系统学分析 |
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| 刘楚吾 徐田军 刘丽 郭昱嵩 董秋芬 |
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| 关键词:笛鲷属 16S rRNA 序列比较 分子系统学 |
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| 主要内容:对笛鲷属9种鱼的线粒体DNA 16S rRNA基因片段进行了PCR扩增,扩增产物经纯化后测序,得到了长度为561bp的分析序列。结合GenBank中的另外9种笛鲷的16S rRNA同源序列计算得出A、T、G、C的含量平均为28.5%、22.1%、23.6%和25.8%,AT含量稍高于GC含量,18种笛鲷碱基组成差异不大。利用MEGA3.1软件对所得序列进行比对后检测到72个变异位点,其中包括简约信息位点44个,在变异位点中75.61%的碱基替换是由于发生了转换,转换/颠换平均为3.1:1。计算了种间的遗传距离,结果表明,序列差异在0.0193—0.0680之间,其中勒氏笛鲷和金焰笛鲷、勒氏笛鲷和金带笛鲷的序列差异最小,而红鳍笛鲷和金焰笛鲷、红鳍笛鲷和画眉笛鲷的序列差异最大。选用高体四长棘鲷(Argyrops spinifer)为外群,利用NJ法构建了分子系统树,结果表明:本研究中的9种南海笛鲷与其它9种笛鲷进化关系较远;并且南海9种笛鲷相互之间仍然保持着着相对较远的遗传距离,遗传多样性较好, |
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| 《海洋与湖沼》 2009(5).-563-571 |
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