斜带石斑鱼脂肪酸去饱和酶和延长酶基因全长cDNA序列的克隆与分析
 
李观贵 梁旭方 何珊 郁颖 陈晓艳 黄柏炎 程龙球

关键词:脂肪酸去饱和酶 脂肪酸延长酶 基因克隆 斜带石斑鱼Epinephel~coioides
 
主要内容:利用逆转录聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT—PCR)和eDNA末端快速扩增(rapid—ampli6cation of cDNA ends,RACE)方法获得斜带石斑鱼跏inephelus coioide5肝脏中控制高不饱和脂肪酸合成的脂肪酸去饱和酶(fattv acid desaturase,FAD)和脂肪酸延长酶(fattv acid elongase,ELO)基因的全长eDNA序列。结果表明,FAD基因的全长cDNA序列长1979bp,含1338bp的开放阅读框(openreadingframe,ORF),编码445个氨基酸。编码的蛋白序列含有FAD全部的特征结构区.包括3个组氨酸簇、2个跨膜区和1个细胞色素b5结构域,与金头鲷跏㈣aurata、大麻哈鱼Oncorhynchusketa、鲤鱼Cyprin蛐carpio和斑马鱼DaniorerioFAD的氨基酸同源性为66.5%一90.8%。二级结构分析显示其以螺旋和B折叠为主,系统进化分析表明其与金头鲷和欧洲鲈鱼的亲缘关系最近。ELO基因的全长eDNA序列1228bp,含有885bp的开放阅读框,编码294个氨基酸。该蛋白序列含有单一的氧化还原中心组氨酸簇、内质网停留信号和多个跨膜区等ELO特征结构区.与金头鲷、大麻哈鱼、尼罗罗非鱼Oreochromisniloticus和斑马鱼ELO的氨基酸同源性为71.1%-85.7%。蛋白二级结构预测表明其含有丰富的螺旋和B折叠结构,系统树分析显示其与金头鲷亲缘关系最近。斜带石斑鱼FAD和ELO全长eDNA序列的获得.为今后进一步研究其高不饱和脂肪酸合成途径奠定基础。
 
《热带海洋学报》  2009(6).-95-102
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