具有受限存储器的高覆盖度样本的变体调用
 
WOUS23026089  2023-6-23  发明申请

2023-12-28
 
  本文描述了用于识别可调用区域并在分配的存储器内操作时执行变体调用的系统、方法和装置。 测序子系统可以包括变体调用器或变体调用器子系统。 变体调用者可以包括调用子系统,该调用子系统被配置为识别可调用区域并且可以将可调用区域发送到变体调用者的下游基因分型子系统。 变体调用器的调用子系统可以被配置为在多个读段的深度高于可调用区域深度阈值时检测测序数据的可调用区域。 变体调用器的调用子系统可以监视可调用区域所使用的存储器,并且当所使用的存储器超过所分配的存储器总量的存储器阈值时,调用子系统可以分割或溢出可调用区域的至少一部分以在所分配的存储器总量内操作。
 
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