用于检测用于测序的核苷酸样品载玻片内的气泡的机器学习模型
 
CA3214148  2022-3-23  发明申请

2022-10-6
 
  公开了用于基于测序运行期间的碱基调用期间捕获的(或来源于)数据准确且有效地检测气泡何时影响核酸测序运行的方法、系统和非暂时性计算机可读介质。 特别地,在一个或多个实施方式中,所公开的系统在测序循环期间接收鉴定核碱基调用的数据和鉴定核碱基调用的质量度量的数据。 基于特定的核碱基调用和用于质量度量的阈值标记,所公开的系统利用机器学习模型来检测核苷酸样品载玻片中气泡的存在。 除了简单地检测气泡的存在之外,所公开的系统还可以对不同的检测到的气泡进行分类,例如气泡、油泡或鬼泡,或测序期间的其他输出。 通过利用调用数据和质量度量,所公开的系统可以在平台不可知的方法中使用容易获得的测序数据,以使用唯一训练的机器学习模型来检测气泡。
 
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