| 一种应用NGS检测HIV-1耐药基因的方法 |
| CN202310495178.7 2023-5-5 发明申请 |
| 2023-8-4 |
| 本发明公开了一种应用NGS检测HIV?1耐药基因的方法，首先从检测样本中提取HIV?1病毒的RNA，通过RT?PCR、巢式PCR扩增pol区包含耐药突变位点的基因片段，最后利用电泳对扩增样品进行检测；然后对目的基因片段化、加标签，最后混合样本，变性稀释到上机浓度，之后在Miniseq测序仪上对混合文库进行2×150bp的双端NGS测序；最后对下机数据进行过滤、质控和拼接，从中提取出测序深度和覆盖率，并利用斯坦福大学HIV耐药解释系统对数据进行分析与报告。本发明的方法，可检测到突变频率为10％以下的耐药位点，检测灵敏度更高，对HIV?1病毒的前期筛查检测及发病后医生制定更为有效的用药方案具有重要意义。 |
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