| 大规模迁徙过程背景下预测HIV-1耐药形式在社会中传播的方法 |
| UAU202204549 2022-12-2 实用新型 |
| 2023-8-2 |
| 一种在大规模迁徙过程的背景下预测HIV-1抗性形式在社会中传播的方法，其包括指标的收集和研究，针对该指标，在一定地理区域内采取代表性数量的HIV阳性血液样本，在遗传分析仪上进行HIV基因分型的测试系统的帮助下，选择HIV-1作用基因的序列，使用序列比对程序对它们进行比对， 然后手动编辑比对，去除与HIV-1对药物的抗性相关的密码子位置，最后比对GenBank数据库2253-3216中对应于NHV2病毒分离株的完整基因组的位置的密码子序列，然后进行加日期的系统原的经验后验分布，以地理跟踪大多数病毒迁移事件起源的位置。 然后将核苷酸序列与全局代表性亚型数据集组合，并使用基于大型系统发育树的最大概率RaxML(Randomized Axelerated Maximum Likelihood)进行顺序和并行分析的程序来重建最大似然ML(Maximum Likelihood)的系统发育树，并在其基础上预测HIV抗性形式的地理分布。 |
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