| 用于检测用于测序的核苷酸样品载玻片内气泡的机器学习模型 |
| US17656173 2022-3-23 发明申请 |
| 2022-10-6 |
| 本发明公开了基于测序运行期间碱基调用期间捕获的(或从测序运行期间碱基调用导出的)数据,用于准确和有效地检测气泡何时影响核酸测序运行的方法,系统和非瞬时计算机可读介质。 特别地,在一个或多个实施例中,所公开的系统在测序周期期间接收标识核碱基调用的数据和标识核碱基调用的质量度量的数据。 基于质量度量的特定核碱基调用和阈值标记,所公开的系统使用机器学习模型来检测核苷酸样品载玻片中气泡的存在。 除了简单地检测气泡的存在之外,所公开的系统还可以在排序期间对不同的检测到的气泡进行分类,例如气泡,油气泡或重影气泡,或其它输出。 通过使用呼叫数据和质量度量,所公开的系统可以在平台未知的方法中使用容易获得的排序数据来使用唯一训练的机器学习模型来检测气泡。 |