用于检测拷贝数变异的方法、设备和介质
 
CN202210664065.0  2022-6-14  发明申请

2022-7-15
 
  本发明涉及一种用于检测拷贝数变异的方法、设备和介质。该方法包括:基于比对结果数据,计算每一条读长在参考基因组中的位置;将基因组按照预定尺寸的窗口进行划分,以便统计每一个窗口内的唯一比对数;针对每一个窗口内的唯一比对数进行预处理;基于经由预处理的唯一比对数,分别针对每条染色体上的可能添加的断点,进行第一类型片段拟合,以便确定所划分的第一类型片段和关于第一类型片段的断点集合;以及针对所划分的第一类型片段,计算每个窗口的重复表征数据和缺失表征数据,以便确定关于重复第二类型片段和缺失第二类型片段的断点集合,以用于确定拷贝数变异。本发明针对低深度全基因组测序,显著提高检测拷贝数变异的准确性。
 
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