| CT通过簇分析测定与可变簇端点 |
| CA2561458 2006-9-28 发明申请 |
| 2007-3-29 |
| 系统和方法用于确定所述周期阈值(Ct)值在一个PCR扩增的动力学曲线。该PCR数据组可以被一个二维曲线中可视化的荧光强度(Y-轴)对周期数(X轴)。所述数据组被变换以产生一个分区表数据的点与一个coluMn包括所述在循环的荧光(N)和第二列包括所述荧光在周期(n+i)，其中i是通常1或更大。一簇分析过程被施加到所述分区表数据组以确定多个簇的在所述partiti表数据组上。在一个方面，所使用的聚类方法包括一个k均值聚类算法，其中所述识别的簇的数目，k; 是大于或等于threE。在另一个方面，周围的一个分区medoids(pam)算法被用于识别三个或多个簇。使用所述识别的簇，每个所述簇的一个直线的斜率是基于确定的Y(n+1)对n，，和用于每个簇，一个比所述S10的其簇的PE与一个相邻的所述斜率簇是确定的。然后所述比率进行比较。一簇的一个端点具有最大或最小比表示一个感兴趣的特定点在所述数据曲线。所述数据点表示所述弯头或CT增值E所述PCR的曲线isidentified作为一个端点所述识别的一个的簇，和第E循环数对应于该数据点被返回或显示。 |
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