| 通过具有可变簇端点的聚类分析进行CT测定 |
| US11423377 2006-6-9 发明申请 |
| 2007-3-29 |
| 用于在动态PCR扩增曲线中确定循环阈值(CT)值的系统和方法。 PCR数据组可以在荧光强度(y轴)对循环数(x轴)的二维图中可视化。 对数据集进行变换以产生数据点的划分表，其中一列包括周期(n)的荧光，而第二列包括周期(n+i)的荧光，其中i通常为1或更大。 将聚类分析过程应用于分区表数据集中以确定分区表数据集中的多个聚类。 在一个方面，所使用的聚类过程包括k-均值聚类算法，其中所识别的聚类的数目k大于或等于3。 在另一个方面，使用围绕模态划分(PAM)算法来识别三个或更多个簇。 使用所识别的簇，基于y(n+1)对n来确定每个簇的线性斜率，并且对于每个簇，确定该簇的斜率与相邻簇的斜率的比率(ratio)。 然后比较这些比率。 具有最大或最小比率的簇的端点表示数据曲线中的特定关注点。 将表示PCR曲线的肘或CT值的数据点标识为所标识的簇之一的端点，并且返回或显示对应于该数据点的周期号。 |
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