| 甘蓝型油菜芥酸含量基因的高通量基因组特异性分子标记 |
| US11965936 2007-12-28 发明申请 |
| 2008-7-3 |
| A基因组中BN-FAE1.1基因的单碱基改变和C基因组中BN-FAE1.2基因的双碱基缺失产生了在油菜籽中观察到的芥酸含量几乎为零。 在该研究中使用来自B.rapa BAC文库的BAC克隆锚定BN-FAE1.1和来自B.oleracea BAC文库的BAC克隆锚定BN-FAE1.2。 在对基因侧翼区进行测序之后，发现这两个FAE1同源物侧翼序列的不同有助于设计能够在异源四倍体甘蓝型油菜中扩增相应基因组的基因组特异性引物。 C基因组基因中的双碱基缺失作为序列特征性序列区(SCAR)标记被检测。 为了提高产量，用四种荧光染料标记一种基因组特异性引物，并与20种不同的引物组合以产生具有不同片段大小的PCR产物。 最终，同时检测到80个样品的超级池，使得有可能使用中等容量ABI3100遗传分析仪每天分析超过50万个样品。 这大大降低了标记检测的成本。 使用ABI快照试剂盒作为单核苷酸多态性(SNP)标记检测BN-FAE1.1基因中的单碱基改变。 多路复用引物组是通过向5''引物末端添加polyT来设计的，以增加通过样品汇集的SNP检测吞吐量。 这些多路复用的高通量分子标记已经在我们的油菜/油菜育种程序中成功地实现。 |
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