siRNA及其它靶寡核苷酸降解产物和稳定性的评价方法
 
US12403597  2009-3-13  发明申请

2009-9-17
 
  本发明提供了通过对体内或体外降解产物的类型和数量以及核酸(例如小干扰RNA(siRNA)和其它靶寡核苷酸)的稳定性进行测序来评估的方法和组合物。 通常,所公开的方法涉及使用包含双链区、任选环(在发夹测试器的情况下)和与全长和缩短的靶寡核苷酸互补的单链3''突出部分的测试器寡核苷酸。 一种检测仪设计成使得相应靶寡核苷酸的3''端退火到紧邻检测仪5''端的突出部分。 如果在检测仪和其相应靶之间存在匹配,则在相邻位置处检测仪和靶的并置端允许连接酶连接链。 通过对连接位点区域中的连接产物进行测序,可以确定靶寡核苷酸或整个靶的3''末端的序列及其在样品中的相对量。
 
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