用于芥酸含量高通量的基因组特异性分子标记基因的甘蓝型油菜中(L。);
 
CA2612505  2007-12-28  发明申请

2008-6-28
 
  一种单碱基变化,在该Bn-fae1.1所述的基因组中基因和一种两个-基的缺失在该Bn-fae1.2基因在该C基因组产生所述卡诺拉中观察到的芥酸的含量几乎为零。一种BAC克隆的锚定Bn-fae1.1从一种B。rapa)BAC文库和一种BAC克隆锚定Bn-fae′1.2从B。OLERACEABAC文库是用于在该研究。测序后所述基因侧翼区域,它被发现,该dissimilarity该侧翼的序列的这些两个fae1促进该设计同系物的基因组特异性引物是可扩增该相应的基因组在allotetraploidB。napus。所述两个-基的缺失在该C的基因组基因被检测作为一种序列特征序列区(scar)标记。以增加该通量,一个基因组特异性引物是标记有四个荧光染料和组合与20不同的引物以产生PCR产物与不同片段的大小。最终,一种超池的80样品被检测的同时,使它可能以分析在样品的一半1, 000, 000\/天使用一种介质容量ABI3100的遗传分析仪。这显著地降低了成本的标记物检测。所述的单碱基变化,在该Bn-fae1.1基因被检测为单核苷酸多态性(snp)标记用的快照ABI试剂盒。一种多路复用的引物组被设计成通过加入一种polyt到所述5‘引物端,以增加SNP检测通量通过样品汇聚。这些多路复用高通量的分子标记已经成功地实现在我们的卡诺拉\/菜籽育种程序。
 
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