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基于皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)EST数据库的串联重复序列特征分析 |
作者:袁泽轶[1,2] 张琳琳[1,2] 张国范[1]; 出处:海洋通报. 2010(1).-59-64 |
关键词:皱纹盘鲍 EST 串联重复序列 SSR |
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文章摘要:皱纹盘鲍大规模EST的分析研究较少,为了研究其基因组转录本的基本特征并为皱纹盘鲍中开发EST-SSR功能性标记奠定基础,我们利用生物信息学手段对NCBI公共数据库中的5784条皱纹盘鲍EST序列进行EST-SSR特征分析。分析结果表明:(11皱纹盘鲍EST中串联重复序列类型丰富;(2)皱纹盘鲍EST Gene Ontology注释序列SSR类型单一;(3)皱纹盘鲍EST-SSR分布广泛富,是EST-SSR标记开发的优良资源。 |
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